Na naszym Wydziale działają następujące koła naukowe. Skupiają one studentów pragnących aktywnie pogłębiać swoją wiedzę, rozszerzając umiejętności zdobyte podczas "regularnych" zajęć.

• Koło Naukowe "FOREVER YOUNG" przy Katedrze Mechaniki Budowli
• Koło Naukowe Geometrii i Grafiki Inżynierskiej "KRESKA"
• Koło Naukowe "HEVELIUS"
• Koło Naukowe Inżynierii Drogowej i Kolejowej "KoDiK"
• Koło Naukowe PG Inżynierii i Gospodarki Wodnej "Konfuzor"
• Koło Naukowe Konstrukcji Stalowych KoKS
• Koło Naukowe Mechaniki Budowli "KOMBO"
• Koło Naukowe Mikrobiologia w Inżynierii Środowiska "MiŚ"
• Koło Naukowe Młodych Polskiego Związku Inżynierów i Techników Budownictwa
• Koło Naukowe Młodych Mostowców PG "MOST WANTED"
• Koło Nauk o Ziemi Studentów i Doktorantów Politechniki Gdańskiej ,,GeoFLOW" 
• Koło Naukowe Technologii Betonu "KoBET"
• Koło Naukowe Technologii i Organizacji Budowy "KOBRa"
• Koło Naukowe Transportu i Budownictwa Morskiego i Śródlądowego
• Miedzywydziałowe Koło Naukowe Studentów PG Ekologia Budownictwa i Inżynierii Środowiska "EBiIŚ"
• Koło Sportowców WILiŚ